PREZENTACJA INSTYTUTU BIOLOGII EKSPERYMENTALNEJ

Tematyka badawcza:

• badania biofarmaceutyków
• badania cytotoksyczności związków pochodzenia naturalnego oraz syntetyzowanych de novo o charakterze przeciwnowotworowym
• ocena genotoksyczności związków o potencjalnej aktywności przeciwnowotworowej
• analiza stopnia proliferacji komórek oraz przebiegu cyklu komórkowego
• ocena stopnia indukcji apoptozy i nekrozy w komórkach człowieka (model in vitro)
• analiza poziomu stresu oksydacyjnego
• badanie procesu starzenia komórkowego w komórkach nowotworowych i prawidłowych (in vitro)
• badania z użyciem technik inżynierii genetycznej
• produkcja rekombinowanych białek o właściwościach przeciwbakteryjnych i przeciwnowotworowych w różnych systemach ekspresyjnych
• detekcja białek (Western Blot)

Metody badawcze:

• PCR, RT-PCR
• klonowanie molekularne
• elektroforeza kwasów nukleinowych i białek
• Western Blot, Southern Blot
• testy immunocytochemiczne
• mikroskopia świetlna i fluorescencyjna
• rekombinacja i transformacja DNA
• hodowle komórkowe linii nowotworowych i prawidłowych człowieka 
• testy cytotoksyczności, w tym: MTT, LDH
• testy genotoksyczności, w tym test kometowy w wersji neutralnej i alkalicznej, test relaksacji plazmidowego DNA
• testy aktywności kaspaz 8/9/3/7
• cytometria przepływowa
• metody bioinformatyczne w badaniach in silico

Tematyka badawcza:

• badania biofarmaceutyków
• badania cytotoksyczności związków pochodzenia naturalnego oraz syntetyzowanych de novo o charakterze przeciwnowotworowym
• ocena genotoksyczności związków o potencjalnej aktywności przeciwnowotworowej
• analiza stopnia proliferacji komórek oraz przebiegu cyklu komórkowego
• ocena stopnia indukcji apoptozy i nekrozy w komórkach człowieka (model in vitro)
• analiza poziomu stresu oksydacyjnego
• badanie procesu starzenia komórkowego w komórkach nowotworowych i prawidłowych (in vitro)
• detekcja białek (Western Blot)
• biotechnologia molekularna
• badania biofarmaceutyków
• inżynieria genetyczna
• produkcja rekombinowanych białek o właściwościach przeciwbakteryjnych i przeciwnowotworowych w różnych systemach ekspresyjnych
• inżynieria metaboliczna komórek
• konstrukcja alternatywnych wektorów do transformacji
• transformacja genetyczna

Metody badawcze:

• PCR, RT-PCR, qPCR
• elektroforeza kwasów nukleinowych i białek
• testy immunocytochemiczne
• mikroskopia świetlna i fluorescencyjna
• hodowle komórkowe linii nowotworowych i prawidłowych człowieka
• testy cytotoksyczności, w tym: MTT, fiolet krystaliczny, czerwień obojętna
• testy genotoksyczności, w tym test kometowy w wersji neutralnej i alkalicznej, test relaksacji plazmidowego DNA
• markery apoptozy
• testy aktywności kaspaz 8/9/3/7
• cytometria przepływowa
• markery stresu oksydacyjnego
• metody bioinformatyczne w badaniach in silico
• klonowanie molekularne
• mikrorozmnażanie w warunkach in vitro
• techniki prowadzenia hodowli komórkowych i kultur in vitro
• transformacja genetyczna
• izolacja genomowego DNA (metoda CTAB, SDS)
• izolacja plazmidowego DNA z bakterii
• Western blot, Southern blot

Tematyka badawcza:

• biotechnologia molekularna,
• badania biofarmaceutyków
• inżynieria genetyczna
• produkcja rekombinowanych białek o właściwościach przeciwbakteryjnych i przeciwnowotworowych w różnych systemach ekspresyjnych
• inżynieria metaboliczna komórek
• konstrukcja alternatywnych wektorów do transformacji
• transformacja genetyczna

Metody badawcze:

• PCR, qPCR
• elektroforeza w żelu agarozowym i poliakrylamidowym
• klonowanie molekularne
• mikrorozmnażanie w warunkach in vitro
• techniki prowadzenia hodowli komórkowych i kultur in vitro
• transformacja genetyczna
• izolacja genomowego DNA (metoda CTAB, SDS)
• izolacja plazmidowego DNA z bakterii
• elektroforeza kwasów nukleinowych i białek
• Western blot, Southern blot
• testy histochemiczne
• mikroskopia świetlna i fluorescencyjna

Tematyka badawcza:

• reakcje ciał Cajala na czynniki stresowe
• struktura, funkcja i aktywność transkrypcyjna jąderek. Reakcje jąderek na czynniki stresowe
• biosynteza, struktura i funkcja kutikuli roślinnej i zwierzęcej. Roślinne struktury lipidowe
• regulacja embriogenezy roślin, ze szczególnym uwzględnieniem roli kinaz MAPK
• wpływ herbicydów na rozwój roślin. Komórkowe aspekty zabiegów agrotechnicznych
• naturalne związki chemiczne jako alternatywne środki ochrony roślin
• mechanizmy regulacyjne cyklu komórkowego u roślin
• przedwczesna kondensacja chromosomów. Niestabilność chromosomowa i genomowa
• uszkodzenia DNA i naprawa DNA. Stres replikacyjny. Timing replikacyjny
• zależności oksydacyjno-replikacyjne u roślin w warunkach stresu

Metody badawcze:

• klasyczna mikroskopia świetlna i fluorescencyjna
• mikroskopia elektronowa
• agarozowa i poliakrylamidowa elektroforeza żelowa
• cytochemia, immunocytochemia i metody „immunoblot”
• spektrofotometria i mikrocytofotometria
• chromatografia cienkowarstwowa i jonowymienna oraz sączenie molekularne
• analizy ilościowe metabolitów komórkowych, w tym kwasów nukleinowych, cukrów, białek, hormonów roślinnych oraz pomiary aktywności enzymatycznej

Tematyka badawcza:

• fizjologiczne, biochemiczne i molekularne mechanizmy odporności roślin na abiotyczne stresy środowiskowe – indukcja strategii obronnych roślin
• Arabidopsis thaliana jako gatunek modelowy w badaniach fizjologii stresu, z wykorzystaniem zmienności naturalnej (ekotypy) i indukowanej (mutanty), w hodowlach in vivo i in vitro
• mechanizmy i regulacja procesu śmierci komórek roślinnych w zawiesinowych kulturach in vitro tytoniu Nicotiana tabacum BY-2
• badanie własności fitozwiązków w kontekście pozyskiwania nowych źródeł żywności funkcjonalnej, nutraceutyków i kosmeceutyków
• nowe naturalne biostymulatory roślin
• optymalizacja ekouprawy biomasy roślin energetycznych
• fitoremediacja - rośliny w odnowie środowiska i renaturyzacji wód

Metody badawcze:

• sterylne hodowle roślin in vitro
• testy biochemiczne (w tym, aktywność proteolityczna, enzymy AOX, testy ABTS+, FRAP, DPPH, βCBT, FeMICA) i markery stresu (m.in. TBARS, prolina, polifenole, OxiProt, H2O2, O2*-, dysfunkcje błon)
• techniki molekularne: elektroforezy 1- i 2-D, zymogramy, immunodetekcja, Western Blot
• barwienia histochemiczne
• mikroskopia świetlna i konfokalna
• eksperymenty z wykorzystaniem roślinnych gatunków modelowych (Arabidopsis thaliana, Nicotiana tabacum, etc.), wykorzystanie mutantów (w tym mutantów T-DNA i narzędzi genetyki wstecznej) do analizy funkcjonalnej genów, badanie ekspresji i lokalizacji wybranych białek, klonowanie genów/przygotowanie konstruktów genowych, transformacje poprzez Agrobacterium, testy komplementacji funkcjonalnej

Tematyka badawcza:

• Fizjologiczne, biochemiczne i molekularne mechanizmy odporności roślin na abiotyczne stresy środowiskowe. Indukcja strategii obronnych roślin
• Arabidopsis thaliana jako gatunek modelowy w badaniach fizjologii stresu, z wykorzystaniem zmienności naturalnej  i indukowanej w hodowlach in vivo i in vitro
• Wpływ czynników abiotycznych na wzrost i rozwój roślin – w tym także regulacja procesu programowanej śmierci komórek roślinnych w zawiesinowych kulturach in vitro tytoniu Nicotiana tabacum BY-2
• Poprawa jakości materiałów siewnych przez dobór i wykonanie różnych zabiegów priming’u tj. kondycjonowania nasion
• Naturalne biostymulatory roślin – poszukiwania i zastosowanie
• Rola melatoniny w roślinach (fitomelatonina)
• Badanie właściwości przeciwutleniających fitozwiązków w kontekście pozyskiwania nowych źródeł żywności funkcjonalnej i naturalnych kosmeceutyków
• Optymalizacja uprawy biomasy roślin energetycznych. Ekouprawy z wykorzystaniem metabolitów glonów i sinic
• Fitoremediacja – rośliny w odnowie środowiska i renaturyzacji wód

Metody badawcze:

• Hodowle tradycyjne (w glebie), hydroponiczne i in vitro
• Biotesty, testy fizjologiczne
• Pomiar aktywności fotosyntetycznej i fluorescencji chlorofilu
• Analizy biochemiczne, testy enzymatyczne
• Proteomika - rozdziały elektroforetyczne jedno i dwuwymiarowe
• Techniki biologii molekularnej – pracownia GMO

Tematyka badawcza:

• Mechanizmy strategii obronnych roślin wobec stresów abiotycznych
• Poszukiwanie naturalnych biostymulatorów roślin i nowatorskich metod wprowadzania ich do roślin
• Dobór i aplikacja priming’u w celu poprawy jakości nasion
• Ekouprawy biomasy roślin energetycznych
• Fitozwiązki w żywności funkcjonalnej i kosmeceutykach
• Badania i testy na gatunkach modelowych, a także makrofitach wodnych i roślinach uprawnych w warunkach in vivo i in vitro

Metody badawcze:

• Komórkowe kultury zawiesinowe in vitro
• Testy biochemiczne
• Techniki molekularne: elektroforezy 1- i 2-D, zymogramy, immunodetekcja, Western blot
• Barwienia histochemiczne, mikroskopia świetlna i konfokalna
• Izolacja genomowego i plazmidowego DNA
• PCR
• Izolacja i oczyszczanie białek
• Elektroforeza w żelu agarozowym
• Analizy spektrofotometryczne
• Analiza funkcjonalna genów (wykorzystanie mutantów T-DNA i narzędzi genetyki wstecznej)

Tematyka badawcza:

• roślinne kultury in vitro. Rozmnażanie roślin ozdobnych, użytkowych, leczniczych, ginących techniką kultur  in vitro
• produkcja metabolitów wtórnych o właściwościach leczniczych i prozdrowotnych, barwników spożywczych i kosmetycznych, ekologicznych środków ochrony roślin i antyoksydantów w roślinnych kulturach in vitro
• biochemiczne mechanizmy odporności roślin na patogeny i szkodniki. Odporność roślin na stresy środowiskowe: zasolenie, kwaśny deszcz, metale śladowe
• fizjologia roślin, współdziałanie szlaków metabolicznych w warunkach prawidłowych i patologicznych/stresowych, wpływ efektywności fotosyntezy na metabolizm rośliny
• fitoremediacja; wykorzystanie roślin w oczyszczaniu gleb, wód gruntowych i powietrza ze związków toksycznych pochodzenia antropomorficznego

Metody badawcze:

• hodowla roślin w glebie, hydroponiczna, in vitro
• izolacja organelli komórkowych
• spektrofotometryczne i fluorymetryczne oznaczanie aktywności enzymów i stężenia związków
• immunochemiczne oznaczanie zawartości hormonów roślinnych
• histochemiczne oznaczanie reaktywnych form tlenu
• identyfikacja i oznaczanie zawartości metabolitów za pomocą wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC) i spektrometrii mas (MS)
• biotesty aktywności przeciwdrobnoustrojowej metabolitów wtórnych
• mikroskopia fluorescencyjna i  konfokalna
• elektroforeza białek w żelu poliakrylamidowym w warunkach natywnych i denaturujących

Tematyka badawcza:

• Reakcje roślin na stres środowiskowy i proekologiczne metody ochrony roślin
• Analiza fitotoksyczności prób środowiskowych skażonych trwałymi zanieczyszczeniami organicznymi i metalami ciężkimi
• Fitoremediacja - innowacyjne rozwiązania w zakresie zastosowania roślin do usuwania zanieczyszczeń z matryc środowiskowych
• Roślinne kultury in vitro – ratunek dla gatunków zagrożonych i źródło związków bioaktwnych
• Wykorzystanie korzeni transformowanych w systemach biosyntez fitofarmaceutyków i bioaktywatorów odporności roślin oraz biotransformacji związków egzogennych

Metody badawcze:

• Hodowla komórek i tkanek roślinnych in vitro
• HPLC, HPLC-ESI-MS
• Metody histochemiczne
• Elektroforeza
• Mikroskopia świetlna i konfokalna
• Biotesty

Tematyka badawcza:

• badania elektrofizjologiczne w zakresie zjawisk oscylacyjnych i aktywności pojedynczych neuronów wybranych struktur ośrodkowego układu nerwowego
• badania mechanizmów synchronizacji sieci nerwowych, w kontekście rytmu theta generowanego w obszarze hipokampa oraz tylnego podwzgórza
• behawioralne i elektrofizjologiczne badania zjawisk leżących u podstaw zachowań stresowych i wybranych chorób neurodegeneracyjnych
• interakcje zachodzące między układem odpornościowym, a ośrodkowym układem nerwowym
• badania nad regeneracją nerwów obwodowych
• badania w zakresie psychoneuroimmunologii

Metody badawcze:

• rejestracja lokalnych potencjałów polowych oraz zewnątrzkomórkowa rejestracja wyładowań pojedynczych neuronów w warunkach in vitro - skrawki mózgowe
• badania behawioralne gryzoni w powiązaniu z jednoczesną rejestracją aktywności elektrofizjologicznej wybranych obszarów mózgu dzięki implantacji wielokanałowych elektrod przeznaczonych do chronicznych eksperymentów
• techniki elektrofizjologiczne, w tym mikroelektrody, patch-clamp, wielokanałowa rejestracja jednostkowa, umożliwiające analizę potencjałów czynnościowych, sygnałów elektrycznych i przewodnictwa synaptycznego
• metody histologiczne i immunohistochemiczne, pozwalające na badanie struktur tkankowych mózgu oraz identyfikację neuroprzekaźników, receptorów i białek w tkance nerwowej
• mikroskopia świetlna, fluorescencyjna i konfokalna

Tematyka badawcza:

• W obrębie Katedry Neurobiologii funkcjonują cztery laboratoria, w których prowadzone są badania z zakresu neurobiologii, neurofizjologii i neurochemii ośrodkowego układu nerwowego.