Zbadanie stanu ichtiofauny na 80 stanowiskach w rzekach zlewni Pilicy poprzez skupienie się na następujących tematach:
- zmiany w strukturach zespołów ryb i wyodrębnienie w nich tzw. gatunków wskaźnikowych,
- ocena różnorodności biologicznej populacji ryb,
- ocena prawdopodobieństwa kolonizacji zlewni przez gatunki obce,
- koncepcja metapopulacji i metazespołu i ich znaczenie dla ochrony populacji ryb,
- warunki przetrwania populacji ryb w systemie Pilicy, o rozbitej ciągłości zasiedlenia: model funkcjonowania metapopulacji i metazespołu,
- losy subpopulacji ryb w zlewni Pilicy, które są pod wpływem procesów zanikania i odbudowy w wyniku rekolonizacji i zarybiania,
- stabilne, niezagrożone ekstynkcją subpopulacje ryb,
- monitoringowe studia: lata 1963 – 2017,
- istotne zmiany w dominacji poszczególnych grup ekologicznych ryb.
Badania umożliwią stwierdzenie, jakie czynniki są odpowiedzialne za stan ichtiofauny, ale także jakie zabiegi hodowlano-gospodarcze mogą powodować poprawę istniejącego stanu ichtiofauny w rzekach zlewni Pilicy. Badania mają również umożliwić określenie, czy stwierdzona w ostatnich latach istotna poprawa jakości wody w Pilicy umożliwia już wykorzystanie jej jako korytarza ekologicznego, który posłuży do odbudowywania populacji gatunków typowo rzecznych w dużych dopływach Pilicy, np. Drzewiczce czy Wolbórce oraz jakie przedsięwzięcia, np. zarybienia, modyfikacje koryt, itp. będą niezbędne czy wskazane dla realizacji tego celu.